员工在总公司签订了两份劳动合同，是否签订了

第三次与分公司签订不一定是无固定期限合同。依据《劳动合同法》，连续两次固定期限合同后，无过错且适应工作应签无固定期限合同，否则可协商。未及时处理可能导致合同性质不明，引发纠纷。
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不一定签无固定期限。操作如下：1.审查员工前两次合同情况；2.若连续两次固定期限且无过错，应签无固定期限；3.否则，双方可协商签订固定期限、无固定期限等合同；4.确保合同内容合法，避免纠纷。
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处理方式有签订无固定期限或协商其他类型合同。选择时应考虑员工是否无过错且适应工作，以及公司意愿，依法或协商确定合同类型。